Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc12Q8K2L8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc12Q8K2L8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms