Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms