Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip10Q8CJ53 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms