Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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