Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms