Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phc3Q8CHP6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms