Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ep400Q8CHI8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms