Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1l1Q8CGM2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms