Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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