Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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