Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp27Q8CEG8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp27Q8CEG8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp27Q8CEG8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp27Q8CEG8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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