Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc28bQ8CEG5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ccdc28bQ8CEG5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ccdc28bQ8CEG5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ccdc28bQ8CEG5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ccdc28bQ8CEG5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc28bQ8CEG5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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