Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms