Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc87Q8CDL9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms