Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lancl3Q8CD19 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms