Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CCC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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