Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd4aQ8CBY1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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