Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ppfibp1Q8C8U0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms