Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vwc2Q8C8N3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vwc2Q8C8N3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms