Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms