Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms