Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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