Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Camsap2Q8C1B1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Camsap2Q8C1B1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms