Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms