Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctdsp2Q8BX07 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Ctdsp2Q8BX07 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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