Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtpaQ8BWP5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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