Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Triml1Q8BVP1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Triml1Q8BVP1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Triml1Q8BVP1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Triml1Q8BVP1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Triml1Q8BVP1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms