Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcl3Q8BVF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms