Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Suds3Q8BR65 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suds3Q8BR65 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms