Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP78

Fra10ac1, Protein FRA10AC1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fra10ac1Q8BP78 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fra10ac1Q8BP78 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms