Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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