Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gga3Q8BMI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms