Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c2Q8BL74 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c2Q8BL74 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms