Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nop53Q8BK35 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nop53Q8BK35 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nop53Q8BK35 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop53Q8BK35 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nop53Q8BK35 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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