Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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