Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Htatsf1Q8BGC0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms