Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5bQ80Y84 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms