Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms