Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Avl9Q80U56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Avl9Q80U56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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