Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NischQ80TM9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NischQ80TM9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms