Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo2Q7TSY8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo2Q7TSY8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms