Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Dsg1bQ7TSF1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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