Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms