Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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