Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Syne2Q6ZWQ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms