Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Topbp1Q6ZQF0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms