Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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