Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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