Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms