Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cxcl3Q6W5C0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cxcl3Q6W5C0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cxcl3Q6W5C0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cxcl3Q6W5C0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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